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真菌18S rDNA/ITS菌種鑒定
   傳統的真菌分類鑒定主要依據是形態、生長及生理生化變化特征等特征。然而由于真菌種類繁,其生長形態、生理生化變化等隨環境的變化也不穩定。因此,采用傳統方法鑒定有其局限性。隨分子生物技術發展,DNA序列已經廣泛測序。通過對真菌保守變異序列測序,可進行菌種鑒定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通過PCR擴增,測序,與GenBank中的已知序列進行比對后,判定真菌種類,將真菌劃分到屬或種。 
  信諾金達提供擴增真菌18S rRNA序列,約1,700 bp,或ITS,大概在300-700bp,進行擴增,測序,BLAST,對樣品進行鑒定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2兩部分,進化速度快,具有多態性,適于對親緣關系較近的菌株進行區分鑒定。
服務要求
  1.樣品形式可以是新鮮菌液、斜面培養基、平面培養基或者提取好的DNA。
  2.如果樣品為基因組DNA,DNA濃度>10ng/ul,體積大于20ul。
  3.鑒定結果一般可以鑒定到種。個別菌種由于微生物數據庫相關數據缺乏,只能鑒定到屬。如遇這種情況,正常收費。
  4.如果測序結果出現如下套峰,視為樣品不純,本公司將收取全額實驗費用。并建議克隆多個測序鑒定。
  5.對于某些致病性菌體,請提前說明,注意保護工作人員健康及環境衛生。
服務基本流程
  1.信諾金達進行引物設計合成;
  2. PCR擴增18S rDNA/ITS;
  3. PCR產物純化;
  4. 測序,序列比對分析。
服務報告內容
  實驗報告包括PCR產物照片、NCBI序列比對鑒定結果、測序報告、序列堿基圖;
  注:對于鑒定的菌株,我們不做備份及保留,請送檢之前做好保種工作。
服務編號
服務項目
內容說明
價格
周期
SGSBD11
真菌18S rDNA菌種鑒定
18S rDNA序列擴增,PCR產物測序,比對分析
¥500/樣品
1-2周*
SGSBD12
真菌18S rDNA菌種鑒定
18S rDNA序列擴增,克隆測序,比對分析
¥1000/樣品
1-2周*
SGSBD13
真菌18S rDNA文庫構建及真菌群落多樣性分析
18S rDNA文庫構建,RFLP等
詢價
5-6周*
SGSBD14
真菌ITS菌種鑒定
真菌ITS1,ITS4,ITS5全ITS序列擴增,PCR測序鑒定
¥500/樣品
1-2周*
SGSBD15
真菌ITS菌種鑒定
真菌ITS1,ITS4,ITS5全ITS序列擴增,連接T載體測序鑒定
¥1000/樣品
1-2周*

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菌種鑒定常見問題解答


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